16 espèces animales de la Directive "Habitats, Faune, flore" ont pu être recensées sur le site Natura 2000 'rivière Salat'.
| Nom vernaculaire | Nom scientifique | Présence attestée sur le Salat | Espèce recherchée Présence non avérée | |
| Mammifères | Loutre d'Europe | Lutra lutra | X | |
| " | Desman des Pyrénées | Galemys pyrenaicus | X | |
| " | Grand Rhinolophe | Rhinolophus ferrumequinum | X | |
| " | Petit Rhinolophe | Rhinolopus hipposideros | X | |
| " | Rhinolophe euryale | Rhinolophus euryale | X | |
| " | Petit murin | Myotis blythii | X | |
| " | Grand murin | Myotis myotis | X | |
| " | Vespertilion de Bechstein | Myotis bechsteini | X | |
| " | Vespertilion à oreilles échancrées | Myotis emarginatus | X | |
| " | Barbastelle | Barbastella barbastellus | X | |
| " | Minioptère de Schreibers | Miniopetrus schreibersi | X | |
| Reptiles | Cistude d'Europe | Emys orbicularis | X | |
| Crustacés | Ecrevisse à pattes blanches | Astacus pallipes | X | |
| Poissons et agnathes | Saumon atlantique | salmo salar | X | |
| " | Lamproie marine | Petromyzon marinus | X | |
| " | Grande alose | Alosa alosa | X | |
| " | Bouvière | Rhodeus sericeus amarus | X | |
| " | Chabot | Cottus gobio | X | |
| " | Ombre commun | Thymallus thymallus | X | |
| " | Lamproie de Planer | Lampetra planeri | X | |
| " | Toxostome | Chondrostoma toxostoma | X | |
| " | Barbeau méridional | Barbus meridionalis | X | |
| Insectes | Lucane cerf-volant | Lucanus cervus | X | |
| " | Grand capricorne | Cerambyx cerdo | X | |
| " | Cordulie à corps fin | Oxygastra curtisii | X | |
| " | Agrion de Mercure | Coenagrion mercuriale | X |
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Zoom sur les chauves-souris
Les chauves-souris sont bien présentes sur les corridors alluviaux (cours d'eau et abords immédiats) ; en effet, ceux-ci leur procurent le gîte et le couvert.
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Zoom sur l'ombre commun (Thymallus thymallus)
Il s'agit d'un poisson fusiforme, élancé. Le corps est recouvert d'écailles de grande taille. La nageoire dorsale caractéristique, de couleur vive (teintée de pourpre, bleu et de mauve), est haute et très développée ; elle lui a valu le nom de « porte-étendard ».
La coloration de la robe est très variable, suivant les milieux et les conditions physiologiques des individus, pouvant aller du gris plus ou moins foncé au brun vert plus ou moins bronzé.
La taille est comprise entre 30 et 35 cm pour un poids de 500 g environ. Sa durée de vie est en moyenne de 5 ans mais peut aller jusqu’à 10 ans.
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